El mono aullador (Alouatta), que comprende entre nueve y 14 especies y se extiende desde el sur de México hasta el norte de Argentina, es el platyrrhines más ampliamente distribuidos. Aulladores estudios filogenéticos anteriores han utilizado cromosómica y caracteres morfológicos y una serie de marcadores moleculares; Sin embargo, el patrón de ramificación de conflicto entre los estudios o siguen sin resolverse. Hacemos Alouatta nuevo análisis filogenético utilizando tanto concatenados y las especies de árboles coalescentes enfoque basado se basa en 14 áreas de no codificación nuclear intergénica no vinculados.
| Protein-Export Protein SecB (SecB) Protein | |||
| Abbexa | |||
| Protein-Export Protein SecB (SecB) Protein | |||
| Abbexa | |||
| Protein-Export Protein SecB (SecB) Protein | |||
| Abbexa | |||
Nuestro muestreo de taxones incluyendo cinco de las siete especies de América del Sur (Alouatta Caraya, Alouatta belzebul, Alouatta Guariba, Alouatta seniculus, Alouatta sara) y dos especies introducidas de Mesoamérica (Alouatta Pigra, Alouatta palliata). Al igual que en estudios anteriores, nuestra filogenia se apoyó clado clado Mesoamérica y América del Sur. A aulladores América del Sur, ambos métodos de recuperación de la Mata Atlántica endémica A. Guariba como hermanos todas las especies sudamericanas restantes, aunque con un apoyo moderado. Además, no encontramos apoyo para la hermana relación propuesta anteriormente entre A. y A. belzebul Guariba. Por primera vez, un clado formado por A. sara y A. Caraya identificados.
| Paraffin Wax | |||
| Toronto Research Chemicals | |||
| Paraffin wax pellets | |||
| EWC Diagnostics | |||
| Paraffin wax pellets | |||
| EWC Diagnostics | |||
| Paraffin wax Pellets | |||
| EWC Diagnostics | |||
| Paraffin wax Pellets | |||
| EWC Diagnostics | |||
La relación entre otros aulladores América del Sur, sin embargo, no está totalmente apoyada. Nuestras estimaciones de los tiempos de divergencia en Alouatta generalmente más antigua que la estimación en el estudio anterior. Sin embargo, se corresponden con estudios recientes sugieren edad Mioceno para el Istmo de Panamá y para levantar el norte de los Andes. Nuestros resultados también apuntan a un aislamiento genético temprano A. Guariba en el Bosque Atlántico, de acuerdo con la hipótesis de intercambio biótico en las selvas tropicales de América del Sur en el Mioceno. Colectivamente, estos hallazgos contribuirán a una mejor comprensión del proceso de diversificación entre las especies de monos aulladores; Sin embargo, también indican que una mayor comprensión de la historia evolutiva de la radiación Alouatta dependerá de la ampliación del muestreo taxonómico, geográfico y genómico.
| MULTIPLEX KIT PCR MASTITIS PCR kit | |||
| Bioingentech | |||
| MULTIPLEX KIT PCR MASTITIS PCR kit | |||
| Bioingentech | |||
| PCR Mix | |||
| Biochain | |||
| PCR-EZ D-PCR MASTER MIX | |||
| Bio Basic | |||
| MULTIPLEX KIT PCR Babesia & Theileria PCR kit | |||
| Bioingentech | |||
Detección molecular y análisis filogenético de genotipos de Vibrio cholerae en Hillah, Irak.
Vibrio cholerae es una causa grave de diarrea endémica asociada al cólera en muchas zonas del mundo. Un total de 256 hisopos fecales y rectales recogidos de pacientes sospechosos de padecer cólera tratados en tres hospitales de Hillah, Gobernación de Babilonia, Irak, durante el período comprendido entre el 1 de septiembre y el 29 de diciembre de 2017. Después de un cultivo de rutina para el aislamiento y la identificación de los aislados de V. cholerae de las muestras, se realizó una PCR para la detección molecular de los aislados de V. cholerae mediante el gen 16S del ARN ribosomal.
| Rat Cholesterol ELISA ELISA | |
| E01A11128 | BlueGene |
| Goat Cholesterol ELISA ELISA | |
| E01A46041 | BlueGene |
| Mouse Cholesterol ELISA ELISA | |
| E01A19869 | BlueGene |
| Human Cholesterol ELISA ELISA | |
| E01A2368 | BlueGene |
| Sheep Cholesterol ELISA ELISA | |
| E01A98335 | BlueGene |
Toxigenicidad detectada por el gen de la toxina RTX. La técnica PCR destaca la detección molecular de V. cholerae para ocho aislados. Sólo dos aislados (25%) poseían los genes rtxA y rtxC, mientras que sólo tres aislados (37,5%) poseían el gen rtxB. Se realizó la secuenciación del ADN de ocho aislados mediante análisis y árbol filogenético. Se observaron las variantes de las bacterias comparadas con la secuencia de referencia homóloga a sus vecinas utilizando el servidor BLAST (Basic Local Alignment Search Tool; https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi) del Centro Nacional de Información Biotecnológica (NCBI).
| Rat Cholesterol ELISA ELISA | |
| E01A11128 | BlueGene |
| Goat Cholesterol ELISA ELISA | |
| E01A46041 | BlueGene |
Los resultados indican que los ocho aislados de V. cholerae investigados se situaban en tres posiciones filogenéticas diferentes. La secuencia parcial informó de disimilitudes entre los aislados con número de acceso al GenBank MK212155.1 y seis se agrupan con números de acceso al GenBank de la misma especie. Por primera vez en la gobernación de Babilonia, Irak, se informó de la prueba molecular, la secuenciación y los árboles filogenéticos para V. cholerae y sus toxinas aisladas durante el brote de cólera en 2017.
| variable Volume 0,1 -2,5 µl | |
| -LHP1-V01 | Phoenix instrument |
| variable volume 0,5 -10 µl | |
| -LHP1-V05 | Phoenix instrument |
| variable volume 10 -100 µl | |
| -LHP1-V10 | Phoenix instrument |
| variable volume 100-1000 µl | |
| -LHP1-V100 | Phoenix instrument |
| variable volume 1000 -5000 µl | |
| -LHP1-V1000 | Phoenix instrument |
El análisis molecular y filogenético del clado del parvovirus canino 2C Vietnam originario de perros reveló un nuevo Asia-IV
El parvovirus canino de tipo 2 (CPV-2) es un pequeño virus de ADN monocatenario que causa enteritis hemorrágica mortal en perros. Actualmente, el CPV-2 se clasifica en CPV-2a, CPV-2b y CPV-2c en función de la variación genética de un gen VP2. La variante CPV-2c se ha convertido en omnipresente en todo el mundo y la atención para supervisar la evolución de parvoviral. En este estudio, se caracterizaron las secuencias del genoma completo de CPV-2c cepa se obtiene de 59 perros en Vietnam.
El análisis molecular reveló que el CPV-2c de Vietnam comparte el mismo patrón evolutivo con el clado asiático del CPV-2, que se caracteriza por patrones de firmas genéticas de proteínas estructurales y no estructurales. Además, esta cepa de CPV-2c Vietnam Thr112Ile y Ile447Met presentó mutaciones únicas en la secuencia VP1 y VP2, respectivamente. Curiosamente, el análisis filogenético mostró que la mutación de residuos de aminoácidos tanto en genes estructurales como no estructurales ha contribuido a la aparición de un nuevo clado, designado aquí como clado asiático-IV. La tasa de sustitución, estimada a partir del conjunto de datos que contiene 199 secuencias durante los últimos 42 años, confirmó que el CPV-2 mostró un alto grado de sustitución de nucleótidos, aproximadamente 2,49 x 10-4 sustituciones de nucleótidos por sitio por año (nt / s / y), con VP1 / 2 y NS1 / 2 estimación de 3,06 x 10-4 y 3,16 x 10-4 nt / s / y, respectivamente.
| variable Volume 0,1 -2,5 µl | |
| -LHP1-V01 | Phoenix instrument |
| variable volume 0,5 -10 µl | |
| -LHP1-V05 | Phoenix instrument |
| variable volume 10 -100 µl | |
| -LHP1-V10 | Phoenix instrument |
| variable volume 100-1000 µl | |
| -LHP1-V100 | Phoenix instrument |
Aunque no hay evidencia de recombinación genética en la cepa de CPV-2c Vietnam establecida, se observó selección positiva de sitios potenciales tanto en genes estructurales como no estructurales, lo que demuestra que la evolución del virus se ha producido tanto en proteínas estructurales como no estructurales. El análisis genético y la evolución de las secuencias del genoma completo son necesarios para comprender mejor la evolución del CPV-2.
| variable Volume 0,1 -2,5 µl | |||
| Phoenix instrument | |||
| variable volume 0,5 -10 µl | |||
| Phoenix instrument | |||
| variable volume 10 -100 µl | |||
| Phoenix instrument | |||
| variable volume 100-1000 µl | |||
| Phoenix instrument | |||